MapChart is a great charting tool for genetic linkage studies……唉不管它是啥了，这里我们用来绘制基因在染色体上的定位图片。

安装 MapChart

首先进入 MapChart 主页：https://www.wur.nl/en/show/Mapchart.htm ，我们需要下载两样东西，一是软件本体，二是软件的许可文件。

在 这里 下载 MapChart 2.32，下载下来是一个.exe程序。

在 这里 下载许可文件，下载下来是一个.zip压缩文件。

当然，贴心的我已经给你下载好了，如果你下不动的话。点这里

然后是安装。安装的时候可以一路 Next ，这里要注意安装路径。我们可以更改安装 MapChart 的位置，但要记住安在哪里了。

图中显示安装在C盘
图中显示安装在C盘

然后将许可文件解压，得到MapChart.lic，把这个文件复制到 MapChart 的安装路径里，MapChart 就可以正常使用了。

使用 MapChart

使用 MapChart 的方法我参考了这篇文章，但与文章里给出的方法不太相同（是我们老师给的方法）。

MapChart 的使用有一定格式，如下。

chrom 染色体名称 S=0 E=染色体长度

其中，染色体名称可以用你拿到的文件里 Linkage Group 的名字；S=0 固定，染色体长度是每条染色体中后一个 Linkage Group 里 Map position (cM) 的值。

如下，数据以此类推。

chrom LG1 S=0 E=160.4
A 22.3
B 33.9

chrom LG2 S=0 E=160.4
A 22.3
B 33.9

然后打开 MapChart，点击File下面的白色图标

在Data里填入整理好的数据

点击旁边的Chart就可以出图

点击Chart上面的保存按钮，可以保存为.mct的 MapChart 格式，可以用 MapChart 直接打开。或者直接打开 QQ 截图也可以。

如果要加标尺，在顶端菜单栏选择“Tools”，“Chart options”，“Loci”，勾选最后一个“Ruler at page margin”，图中便会有标尺了。

本文作者：mikusa

本文链接：https://www.himiku.com/archives/mapchart.html

版权声明：所有文章除特别声明外均系本人自主创作，转载及引用请联系作者，并注明出处（作者、原文链接等）。